Ядерный генетический материал погибших клеток может встраиваться в хромосомы клеток кожи и замедлять восстановление
Horizontal somatic genome acquisitionВ реконструированной коже и культурах клеток с сохранным TP53, полученных от людей в возрасте 40-60 лет, последовательность нагрузок может замедлять восстановление за счёт встраивания ядерной дезоксирибонуклеиновой кислоты (ДНК) погибших клеток.
Полный текст
Проверяемая гипотеза: последствия последовательности нагрузок закрепляются при встраивании ядерной ДНК погибших клеток в геном выживших дермальных фибробластов. Первая нагрузка создаёт материал для переноса, следующая повышает вероятность его встраивания при восстановлении повреждённой ДНК клетки-реципиента. Совпадение этих событий с определённой биологической фазой определяет число устойчивых вставок, нарушающих работу генов восстановления. Наиболее сильное допущение гипотезы состоит в том, что в коже с сохранным TP53 такие вставки возникают достаточно часто, чтобы влиять на функцию клеток. Согласно тому же допущению, эти вставки в основном объясняют, почему при разных последовательностях нагрузок нарушения восстановления накапливаются по-разному. Накопленные изменения сохраняются в хромосомах уже существующих клеток; эффект возможен и без увеличения численности отдельных клонов. Предотвращение такого встраивания должно стабилизировать SPV_9, сохраняя прежнюю продолжительность восстановления после очередной нагрузки.
В реконструированной коже с различимыми генетическими метками донорских клеток и фибробластов сравнивают разные последовательности одного и того же набора нагрузок в двух биологических фазах.
Полный текст
Число воздействий каждой амплитуды, продолжительность опыта и время после последнего воздействия одинаковы. Неблагоприятная последовательность должна увеличивать число подтверждённых мест соединения донорской ДНК с хромосомной ДНК клетки-реципиента и удлинять восстановление после одинаковой для всех вариантов заключительной пробы. Эффект должен сохраняться после переноса очищенных фибробластов на свежий неминерализованный матрикс. Разрушение ДНК в донорском материале до его контакта с клетками-реципиентами при сохранении сопоставимого количества клеточных остатков должно устранять различие между последовательностями. Для подтверждения функциональной значимости вставок необходимо воспроизвести дефект и устранить его в изогенных клетках. Отсутствие устойчивых вставок при достаточной аналитической чувствительности в сочетании с переносом дефекта только бесклеточным матриксом опровергнет эту гипотезу в пользу IH_Q_L3_M_G4_3_02.
Зародыши фосфата кальция могут накапливаться при повторных нагрузках и ухудшать восстановление формы кожи даёт другое предсказание: В реконструированной коже с различимыми генетическими метками донорских клеток и фибробластов сравнивают разные последовательности одного и того же набора нагрузок в двух биологических фазах.
Полный текст
Число воздействий каждой амплитуды, продолжительность опыта и время после последнего воздействия одинаковы. Неблагоприятная последовательность должна увеличивать число подтверждённых соединений донорской ДНК с хромосомной ДНК реципиента и удлинять время восстановления после одинаковой для всех заключительной пробы. Эффект должен сохраняться после переноса очищенных фибробластов на свежий неминерализованный матрикс. Разрушение ДНК в донорском материале до его контакта с клетками реципиента при сохранении сопоставимого количества клеточных остатков должно устранять различие между последовательностями. Для подтверждения функциональной значимости вставок необходимо воспроизвести дефект и устранить его в изогенных клетках. Отсутствие устойчивых вставок при достаточной чувствительности анализа в сочетании с переносом дефекта только бесклеточным матриксом опровергнет эту гипотезу в пользу IH_Q_L3_M_G4_3_02.