Мышь
Tabula Muris Senis
Атлас старения мыши с измерениями активности генов в отдельных клетках разных тканей и возрастных групп. Доступны обозреватель клеток и обработанные данные для самостоятельного анализа.
Пример исследовательской задачи
Выберите иммунные клетки печени и сравните активность интересующего гена между возрастными группами. Затем проверьте, сохраняется ли различие у отдельных животных.
Условия сравнения
Это данные о мышах. При сравнении учитывайте число животных, пол, ткань и метод выделения клеток. Число клеток и число независимых животных характеризуют разные стороны выборки.
Человек
Tabula Sapiens
Атлас клеток человека из разных органов. Включает данные об иммунных, эпителиальных, эндотелиальных, нервных и других клетках. Измерения можно исследовать в обозревателе CELLxGENE и выгружать для анализа.
Пример исследовательской задачи
Сравните активность выбранного гена в эндотелиальных клетках разных органов, затем проверьте различия между донорами.
Условия сравнения
Атлас служит справочником клеточных типов и состояний. Для выводов о старении отдельно проверьте возрастной состав доноров, доступность сопоставимых образцов и версию набора данных.
Дрозофила
Fly Cell Atlas
Атлас взрослой дрозофилы с данными об отдельных клеточных ядрах и тканях, включая кишечник, сердце и нервную систему. Доступны обозреватель SCope и файлы для анализа.
Пример исследовательской задачи
Найдите клетки кишечника, в которых активен выбранный ген. Используйте их как отправную точку для эксперимента с изменением его активности.
Условия сравнения
Карта клеток взрослого организма помогает выбрать клеточный тип для исследования. Для сравнения старения нужны данные с подходящими возрастными группами; перенос выводов на человека требует отдельной проверки.