New question · All questions and hypotheses

Checking a set of hypotheses

Hypothesis set

Исследования эпилепсии — 10 гипотез с подробными планами экспериментов

Each hypothesis reaches the forecasting models in the form written at the first step, in English and without its author's name.

31 min since the startThe results stay at this address and in the list of all questions, so you can close the page and come back later.
  1. 1GPT-6 Astra writes each hypothesis in one form in EnglishDone10 of 10 written
  2. 2Four models forecast every hypothesisDone4 of 10 selectedGPT-6 Astra: answeredClaude Opus 5.5: answeredGemini 4 Argon: answeredGrok 4.7: answered
  3. 3The selected hypotheses are compared with the literatureIn progress0 of 4 checked

Selected hypotheses

Selected, but already published

The models expect these hypotheses to be confirmed, and published articles already report this result or the opposite one.

H5Proposed by: Исследования эпилепсии

Research question

Предотвращает ли временная блокада TGF-β-пути стойкую гипервозбудимость после альбуминового воздействия через сохранение удаления внеклеточного K⁺?

In a neuron–astrocyte network with albumin-induced astrocyte changes, temporary inhibition of the TGF-β signaling pathway by SB-431542 will prevent subsequent hyperexcitability after compound removal; the effect will be associated with preservation of functional extracellular K⁺ clearance.

В нейрон-астроцитарной сети с альбумин-индуцированным изменением астроцитов временное ингибирование TGF-β-сигнального пути соединением SB-431542 предотвратит последующую гипервозбудимость после удаления вещества; эффект будет связан с сохранением функционального удаления внеклеточного K⁺. Mechanism: Проверяется цепь «альбуминовое воздействие → астроцитарная TGF-β-сигнализация → нарушение калиевого буферирования → стойкая гипервозбудимость». SB-431542 используется как инструмент, но блокирует ALK4/5/7, а не только ALK5. Prediction: КРИТЕРИЙ ПОДДЕРЖКИ ГИПОТЕЗЫ Продолжаем, если раннее вмешательство предотвращает стойкую гипервозбудимость после удаления вещества и сохраняет функциональное удаление K⁺; позднее вмешательство отдельно оценивает обратимость изменений. РЕЗУЛЬТАТ, ПРОТИВОРЕЧАЩИЙ ГИПОТЕЗЕ Если эффект исчезает после полноценной отмывки, это не предотвращение стойкой перестройки. Если гипервозбудимость уменьшается без восстановления K⁺-контроля, отвергаем именно калиевое объяснение. ОБЩИЕ УСЛОВИЯ ПЛАНА. Это непроверенная гипотеза и проект эксперимента, а не полученный результат. Рабочая модель — первичная нейрон-глиальная культура; гиппокампальная культура грызуна является допущением плана. Вид, возраст доноров и состав глии уточняют перед запуском. Пилот длится ориентировочно 2–4 недели при освоенной системе, для новой модели или метода 4–8 недель и более. Концентрации и условия растворов выбирают по первичной статье и проверяют пилотом; они не считаются уже установленными. Основная поисковая серия предусматривает минимум 5 независимых приготовлений на условие; это расчёт ресурсов, а не расчёт статистической мощности. Клетки и чашки внутри приготовления не являются независимыми биологическими повторами. Рандомизация, слепой анализ, балансировка условий по возрасту культуры и дню записи обязательны для предложенного дизайна. Технические исключения определяют заранее; исчезновение спайков после препарата не исключают из анализа. Гипотезу оценивают по электрическим разрядам и сохранению вызванных ответов; Fura-2 — вспомогательный показатель. Загрузка Fura-2 занимает ориентировочно 45–75 минут вне установки; подготовка культуры с посевом 6–8 часов. При одном приборе обычно планируются 3–4 чашки в день, для длинных протоколов 2–3; время загрузки можно частично перекрывать со съёмкой. Анализ при готовом алгоритме — ориентировочно 30–60 минут на чашку. Календарные сроки основной серии считаются от первого посева после завершённого пилота; закупки, разработка новых генетических подходов и окончательная подтверждающая серия не включены. Дополнительные разрушительные анализы, patch-clamp, пилоты концентраций и запас на технические потери не включены в указанное число основных оптических чашек. Все сроки являются плановыми оценками, за исключением отдельно обозначенных опубликованных интервалов. Результаты в клеточной культуре не доказывают клиническую эффективность у человека. ПОДРОБНЫЙ ПЛАН ЭКСПЕРИМЕНТА ИЗ ПОДГОТОВЛЕННОГО ДОКУМЕНТА 10. SB-431542 и стойкая перестройка глии Исходная карточка H13 • Мишень: Альбумин — TGF-β — калиевое буферирование Проверяем: Предотвращает ли временная блокада TGF-β-пути стойкую гипервозбудимость после альбуминового воздействия через сохранение удаления внеклеточного K⁺? Модель и подготовка Нейрон-астроцитарная культура с функциональным калиевым буферированием. Проверяем состав B27/среды и исходное присутствие альбумина. Это модель действия компонента сыворотки, а не полноценный гематоэнцефалический барьер. Что потребуется Альбумин с известной чистотой и низким эндотоксином, SB-431542, TGF-β1 для положительного контроля; электрическая регистрация; pSMAD2/3 и астроцитарные маркеры; K⁺-селективный электрод или калиброванный K⁺-сенсор; по возможности astrocyte patch-clamp. Группы сравнения 6 условий: контроль; альбумин; SB отдельно; альбумин + ранний SB; альбумин + поздний SB; TGF-β1. Для каждого условия отдельные чашки на 24 и 72 часа после общей финальной отмывки. Все группы проходят одинаковые смены среды. Что делаем по шагам Этап Действие Время DIV0–14 Выращиваем культуру, проверяем зрелость астроцитов и возможность измерять удаление K⁺. 14 суток; зрелость может потребовать большего времени DIV14–15 Воздействуем альбумином 24 часа. Ранний SB присутствует в это окно; TGF-β1 — в своей контрольной группе. 24 ч; внесение 15–30 мин на партию DIV15–16 Удаляем альбумин. Поздний SB даём на следующие 24 часа; раннюю группу ведём без SB. В DIV16 все группы проходят общую финальную отмывку. Ещё 24 ч DIV17 и DIV19 На разных чашках исследуем активность через 24 и 72 часа после финальной отмывки. Отдельно подтверждаем достаточность удаления веществ. Две контрольные точки В каждой точке Fura-2, исходная электрическая активность и ответы на одинаковую подпороговую/стандартизованную нагрузку. 45–75 мин загрузка + 60–90 мин запись Параллельный механизм Измеряем скорость восстановления внеклеточного K⁺ после одинаковой нагрузки и показатели TGF-β-пути. K⁺: 60–120 мин на чашку; белковые методы 1–2 дня Один сеанс: 60–90 мин на чашку в каждой временной точке; 3–4 чашки в день. Подготовка воздействия — ещё 5 суток после DIV14. 10. Измерения и сроки Что считаем результатом Главный результат — сохраняющаяся после отмывки электрическая гипервозбудимость и скорость удаления K⁺. Для калиевой цепи важна функция, а не только количество Kir4.1. Механистические точки pSMAD можно брать через 4 и 24 часа на дополнительных образцах. Дополнительные методы Метод / проверка Действие Время Калиевый контроль Калибруем датчик; создаём одинаковую внеклеточную K⁺-нагрузку; измеряем восстановление. Сопоставляем объём, перфузию и диффузию: они сами меняют скорость падения K⁺. Калибровка 30–60 мин в день + 60–120 мин на чашку Астроцитарный механизм pSMAD2/3, Kir4.1 и функциональные токи астроцитов; затем клеточно-специфическая проверка TGF-β-пути и роли Kir4.1. Окрашивание/белок 1–2 дня; patch 90–150 мин на клетку Проверка отмывки Контроль остаточного действия, дополнительные смены среды по валидированному режиму, при необходимости аналитическая проверка. Дополнительные чашки и минимум 1–3 дня наблюдения Объём и календарь Основная оптика: 60 чашек, 15–20 рабочих дней установки. Календарь от первого основного посева после пилота: 6–8 недель. Расширенная функциональная проверка при готовых методах: ориентир 9–12 недель; разработка новых генетических подходов и закупки отдельно. Каждая группа должна включать минимум пять независимых приготовлений. Дополнительные разрушающие анализы и клеточные регистрации не включены в число оптических чашек. Когда продолжаем Продолжаем, если раннее вмешательство предотвращает стойкую гипервозбудимость после удаления вещества и сохраняет функциональное удаление K⁺; позднее вмешательство отдельно оценивает обратимость изменений. Какой результат отвергает гипотезу Если эффект исчезает после полноценной отмывки, это не предотвращение стойкой перестройки. Если гипервозбудимость уменьшается без восстановления K⁺-контроля, отвергаем именно калиевое объяснение. Главная методическая ловушка SB-431542 блокирует ALK4/5/7, поэтому не является специфическим доказательством ALK5. Стартовые 24 + 24 часа и две точки после отмывки — предложенный план; сначала нужно показать, что альбумин действительно меняет вашу культуру. Научная опора Связь альбумина, TGF-β-сигнализации и калиевого контроля исследована ранее [13, 14]. Многодневные изменения поддерживают длительный дизайн; фармакологическую неселективность SB учитываем отдельно [15]. ПЕРВОИСТОЧНИКИ [13] Ivens et al. Альбумин, астроцитарный TGF-β-путь и нарушение калиевого буферирования. Brain, 2007. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/17121744/ [14] Bar-Klein et al. TGF-β-сигнализация и предотвращение приобретённой эпилепсии лозартаном. Annals of Neurology, 2014. https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC4077937/ [15] Inman et al. Профиль ингибирования ALK4, ALK5 и ALK7 соединением SB-431542. Molecular Pharmacology, 2002. https://doi.org/10.1124/mol.62.1.65 [16] Первичное

Mechanism

The proposed chain is albumin exposure → astrocytic TGF-β signaling → impaired potassium buffering → persistent hyperexcitability. SB-431542 is used as a tool, but blocks ALK4/5/7 rather than only ALK5.

Prediction

Support requires early intervention to prevent persistent hyperexcitability after compound removal and preserve functional K⁺ clearance; late intervention separately assesses the reversibility of the changes. If the effect disappears after complete washout, it does not represent prevention of persistent remodeling. If hyperexcitability decreases without restoration of K⁺ control, the potassium explanation specifically is rejected.

Forecasts

GPT-6 Astra: yesClaude Opus 5.5: yesGemini 4 Argon: yesGrok 4.7: yes

Literature

Literature check in progress
H6Proposed by: Исследования эпилепсии

Research question

Уменьшится ли патологическая активность после усиления удаления глутамата, если у культуры действительно есть дефицит этой функции?

In neuron–astrocyte networks with a measured deficit in glutamate clearance, increasing EAAT2 function through treatment with LDN/OSU-0212320 will shorten pathological discharges while relatively preserving brief evoked responses.

В нейрон-астроцитарных сетях с измеренным дефицитом удаления глутамата повышение функции EAAT2 при обработке LDN/OSU-0212320 сократит патологические разряды при относительном сохранении коротких вызванных ответов. Mechanism: Для LDN/OSU-0212320 описано повышение трансляции EAAT2 с участием PKC–YB-1. Функциональная мишень — транспорт глутамата; это не означает прямое связывание вещества с EAAT2. Prediction: КРИТЕРИЙ ПОДДЕРЖКИ ГИПОТЕЗЫ Продолжаем при согласованном улучшении транспорта и сетевой функции; оцениваем, сильнее ли эффект в культурах с исходным транспортным дефицитом. РЕЗУЛЬТАТ, ПРОТИВОРЕЧАЩИЙ ГИПОТЕЗЕ Если захват усилен, а разряды не меняются, отвергаем объяснение через недостаточное удаление глутамата в этой модели. Если разряды уменьшились без роста захвата, механизм EAAT2 не доказан. ОБЩИЕ УСЛОВИЯ ПЛАНА. Это непроверенная гипотеза и проект эксперимента, а не полученный результат. Рабочая модель — первичная нейрон-глиальная культура; гиппокампальная культура грызуна является допущением плана. Вид, возраст доноров и состав глии уточняют перед запуском. Пилот длится ориентировочно 2–4 недели при освоенной системе, для новой модели или метода 4–8 недель и более. Концентрации и условия растворов выбирают по первичной статье и проверяют пилотом; они не считаются уже установленными. Основная поисковая серия предусматривает минимум 5 независимых приготовлений на условие; это расчёт ресурсов, а не расчёт статистической мощности. Клетки и чашки внутри приготовления не являются независимыми биологическими повторами. Рандомизация, слепой анализ, балансировка условий по возрасту культуры и дню записи обязательны для предложенного дизайна. Технические исключения определяют заранее; исчезновение спайков после препарата не исключают из анализа. Гипотезу оценивают по электрическим разрядам и сохранению вызванных ответов; Fura-2 — вспомогательный показатель. Загрузка Fura-2 занимает ориентировочно 45–75 минут вне установки; подготовка культуры с посевом 6–8 часов. При одном приборе обычно планируются 3–4 чашки в день, для длинных протоколов 2–3; время загрузки можно частично перекрывать со съёмкой. Анализ при готовом алгоритме — ориентировочно 30–60 минут на чашку. Календарные сроки основной серии считаются от первого посева после завершённого пилота; закупки, разработка новых генетических подходов и окончательная подтверждающая серия не включены. Дополнительные разрушительные анализы, patch-clamp, пилоты концентраций и запас на технические потери не включены в указанное число основных оптических чашек. Все сроки являются плановыми оценками, за исключением отдельно обозначенных опубликованных интервалов. Результаты в клеточной культуре не доказывают клиническую эффективность у человека. ПОДРОБНЫЙ ПЛАН ЭКСПЕРИМЕНТА ИЗ ПОДГОТОВЛЕННОГО ДОКУМЕНТА 2. LDN/OSU-0212320 и захват глутамата Исходная карточка H02 • Мишень: EAAT2 / GLT-1 Проверяем: Уменьшится ли патологическая активность после усиления удаления глутамата, если у культуры действительно есть дефицит этой функции? Модель и подготовка Смешанная нейрон-астроцитарная культура. Перед большой серией подтверждаем присутствие астроцитов и измеримый натрий-зависимый захват глутамата. Одного окрашивания EAAT2 недостаточно. Что потребуется LDN/OSU-0212320, DHK как фармакологический контроль EAAT2, Fura-2; набор/платформа для функционального захвата глутамата, средства нормирования на белок или число живых клеток; антитела EAAT2, GFAP и нейрональный маркер; электрическая регистрация. Группы сравнения 6 условий: исходная сеть + растворитель; исходная + LDN; индуцированная + растворитель; индуцированная + LDN; индуцированная + DHK; индуцированная + LDN + DHK. Вспомогательные транспортные тесты проводят на отдельных сестринских лунках. Что делаем по шагам Этап Действие Время DIV0–13 Выращиваем культуры, проверяем состав и базовую транспортную функцию на параллельных образцах. 13 суток DIV13–14 Добавляем LDN или растворитель. Рабочая стартовая длительность предобработки — 24 часа. 24 ч ожидания; 15–30 мин внесение на партию Подготовка Загружаем Fura-2. Сохраняем одинаковый режим присутствия/удаления LDN во всех сопоставляемых записях. 45–75 мин вне установки Регистрация Пишем фон, вызываем активность; в назначенных группах применяем DHK с собственным контролем. 25–35 мин Оценка эффекта Измеряем стабильную активность и вызванные ответы; заканчиваем сеанс. 35–55 мин Параллельные образцы В те же сроки измеряем захват глутамата и количество EAAT2. Захват 2–4 ч на партию; белок 1–2 дня Один сеанс: 60–90 мин на чашку после загрузки; 3–4 чашки в день. 2. Измерения и сроки Что считаем результатом Нужны два связанных результата: рост специфического захвата глутамата и уменьшение электрической нагрузки при сохранении коротких вызванных ответов. До вмешательства определяем, какие культуры действительно имеют низкую транспортную функцию. Дополнительные методы Метод / проверка Действие Время Функциональный захват Короткая реакция захвата, остановка, промывки, считывание и нормирование. Нужны натрий-независимый фон и контроль DHK; простое исчезновение глутамата из среды не специфично для EAAT2. 2–4 ч на небольшую партию; при радиоизотопном методе — оснащённая площадка Белок EAAT2 Western blot или количественная иммуноцитохимия на сестринских образцах. 2 календарных дня; 4–8 ч работы на партию Причинная проверка Сопоставляем влияние DHK отдельно и совместно с LDN. При сильном самостоятельном ухудшении от DHK нужен независимый способ уменьшения EAAT2. Дополнительная серия; генетический метод при готовой платформе ещё 2–6 недель Объём и календарь Основная оптика: 30 чашек, 8–10 рабочих дней установки. Календарь от первого основного посева после пилота: 4–6 недель. Расширенная функциональная проверка при готовых методах: ориентир 7–10 недель; разработка новых генетических подходов и закупки отдельно. Каждая группа должна включать минимум пять независимых приготовлений. Дополнительные разрушающие анализы и клеточные регистрации не включены в число оптических чашек. Когда продолжаем Продолжаем при согласованном улучшении транспорта и сетевой функции; оцениваем, сильнее ли эффект в культурах с исходным транспортным дефицитом. Какой результат отвергает гипотезу Если захват усилен, а разряды не меняются, отвергаем объяснение через недостаточное удаление глутамата в этой модели. Если разряды уменьшились без роста захвата, механизм EAAT2 не доказан. Главная методическая ловушка LDN не следует описывать как прямой активатор связывания EAAT2. Увеличение количества транспортёра и его реальная транспортная работа — разные конечные точки. Научная опора В первичной работе смешанные культуры обрабатывали 24 часа; для одного из ключевых опытов использовали DIV7 [3]. Перенос этой длительности на DIV14 — предложенная адаптация, которую проверяет пилот. ПЕРВОИСТОЧНИКИ [3] Kong et al. Усиление трансляции EAAT2 веществом LDN/OSU-0212320. JCI, 2014; в том числе рис. 2 и методы. https://doi.org/10.1172/JCI66163 [16] Первичное исследование пространственно-временных свойств кальциевых транзиентов в гиппокампальных нейронах; методы загрузки Fura-2. Frontiers in Cellular Neuroscience, 2022. https://doi.org/10.3389/fncel.2022.1054950

Mechanism

LDN/OSU-0212320 has been reported to increase EAAT2 translation with involvement of PKC–YB-1. The functional target is glutamate transport; this does not imply direct binding of the compound to EAAT2.

Prediction

Glutamate transport and network function improve together; whether the effect is stronger in cultures with a baseline transport deficit is assessed. If uptake increases but discharges remain unchanged, the explanation based on insufficient glutamate clearance in this model is rejected. If discharges decrease without increased uptake, the EAAT2 mechanism is not established.

Forecasts

GPT-6 Astra: yesClaude Opus 5.5: yesGemini 4 Argon: yesGrok 4.7: yes

Literature

Literature check in progress
H8Proposed by: Исследования эпилепсии

Research question

Можно ли усилить собственное аденозиновое ограничение гиперактивности без сопоставимого подавления обычных ответов?

In a hippocampal neuron–glia culture, inhibition of adenosine kinase by ABT-702 reduces pathological activity more strongly than evoked responses in the baseline network; this advantage depends on A₁ receptors.

В нейрон-глиальной культуре гиппокампа ингибирование аденозинкиназы ABT-702 сильнее снижает патологическую активность, чем вызванные ответы исходной сети; преимущество зависит от A₁-рецепторов. Mechanism: Ингибирование ADK может увеличить доступность аденозина. Последующая активация A₁-рецепторов ограничивает возбуждающую передачу. Избирательность эффекта по состоянию сети — проверяемое предположение. Prediction: КРИТЕРИЙ ПОДДЕРЖКИ ГИПОТЕЗЫ Продолжаем, если ABT уменьшает гиперактивность, относительно сохраняет обычные ответы, а эффект согласуется с A1-зависимостью и подтверждённым действием на ADK/аденозин. РЕЗУЛЬТАТ, ПРОТИВОРЕЧАЩИЙ ГИПОТЕЗЕ Отвергаем идею избирательного торможения, если обычная сеть подавляется не меньше патологической. Отсутствие A1-зависимости заставляет пересмотреть предложенный механизм. ОБЩИЕ УСЛОВИЯ ПЛАНА. Это непроверенная гипотеза и проект эксперимента, а не полученный результат. Рабочая модель — первичная нейрон-глиальная культура; гиппокампальная культура грызуна является допущением плана. Вид, возраст доноров и состав глии уточняют перед запуском. Пилот длится ориентировочно 2–4 недели при освоенной системе, для новой модели или метода 4–8 недель и более. Концентрации и условия растворов выбирают по первичной статье и проверяют пилотом; они не считаются уже установленными. Основная поисковая серия предусматривает минимум 5 независимых приготовлений на условие; это расчёт ресурсов, а не расчёт статистической мощности. Клетки и чашки внутри приготовления не являются независимыми биологическими повторами. Рандомизация, слепой анализ, балансировка условий по возрасту культуры и дню записи обязательны для предложенного дизайна. Технические исключения определяют заранее; исчезновение спайков после препарата не исключают из анализа. Гипотезу оценивают по электрическим разрядам и сохранению вызванных ответов; Fura-2 — вспомогательный показатель. Загрузка Fura-2 занимает ориентировочно 45–75 минут вне установки; подготовка культуры с посевом 6–8 часов. При одном приборе обычно планируются 3–4 чашки в день, для длинных протоколов 2–3; время загрузки можно частично перекрывать со съёмкой. Анализ при готовом алгоритме — ориентировочно 30–60 минут на чашку. Календарные сроки основной серии считаются от первого посева после завершённого пилота; закупки, разработка новых генетических подходов и окончательная подтверждающая серия не включены. Дополнительные разрушительные анализы, patch-clamp, пилоты концентраций и запас на технические потери не включены в указанное число основных оптических чашек. Все сроки являются плановыми оценками, за исключением отдельно обозначенных опубликованных интервалов. Результаты в клеточной культуре не доказывают клиническую эффективность у человека. ПОДРОБНЫЙ ПЛАН ЭКСПЕРИМЕНТА ИЗ ПОДГОТОВЛЕННОГО ДОКУМЕНТА 3. ABT-702 и аденозиновое торможение Исходная карточка H03 • Мишень: Аденозинкиназа и A1-рецепторы Проверяем: Можно ли усилить собственное аденозиновое ограничение гиперактивности без сопоставимого подавления обычных ответов? Модель и подготовка Нейрон-глиальная культура DIV14–16. Сравниваем исходную и индуцированную сеть. Вклад A1-рецептора проверяем отдельным блокирующим контролем, а не только падением кальциевого сигнала. Что потребуется ABT-702, антагонист A1 DPCPX, согласованный растворитель; Fura-2 и электрическая регистрация со стимуляцией. Для углублённой проверки — метод измерения активности ADK или внеклеточного аденозина с валидированным быстрым отбором проб. Группы сравнения 6 условий: исходная + растворитель; исходная + ABT; индуцированная + растворитель; индуцированная + ABT; индуцированная + DPCPX; индуцированная + DPCPX + ABT. Во всех группах одинаковая длительность ожидания и число смен раствора. Что делаем по шагам Этап Действие Время DIV0–14 Выращиваем культуру; пилотом выбираем переносимую концентрацию ABT и рабочую блокаду A1. 14 суток; пилот отдельно Подготовка Загружаем краситель, проверяем перфузию и температуру. 45–75 мин вне установки Фон и модель Пишем исходную активность, затем стабильную гиперактивность. 20–25 мин Контроль механизма В назначенных группах вносим DPCPX; остальным даём соответствующий растворитель. 10–15 мин ABT-702 Вносим ABT или растворитель и наблюдаем эффект до заранее определённого окна оценки. 25–35 мин Функция и завершение Повторяем стандартные стимулы, сохраняем данные, меняем чашку. 20–25 мин Один сеанс: 75–100 мин на чашку после загрузки; 3–4 чашки в день. 3. Измерения и сроки Что считаем результатом Снижение электрической нагрузки сопоставляем с сохранением вызванного ответа в исходной сети. Статистически проверяем взаимодействие ABT × блокада A1, учитывая самостоятельное действие DPCPX. Дополнительные методы Метод / проверка Действие Время Проверка A1-зависимости Сравниваем все четыре условия патологической сети. Исчезновение эффекта при блокаде A1 — поддержка пути, но не прямое измерение ингибирования ADK. Включена в 30 основных чашек Проверка мишени Активность ADK в валидированном тесте либо измерение аденозина. Контролируем деградацию при отборе и связываем время пробы с записью. Ферментный тест обычно 3–5 ч на партию; LC–MS — 1–3 рабочих дня при готовой методике Сохранность функции Вызванные ответы и отсроченная жизнеспособность; при необходимости patch-clamp. 60–120 мин на patch-клетку; отдельная точка через 24 ч Объём и календарь Основная оптика: 30 чашек, 8–10 рабочих дней установки. Календарь от первого основного посева после пилота: 4–6 недель. Расширенная функциональная проверка при готовых методах: ориентир 6–10 недель; разработка новых генетических подходов и закупки отдельно. Каждая группа должна включать минимум пять независимых приготовлений. Дополнительные разрушающие анализы и клеточные регистрации не включены в число оптических чашек. Когда продолжаем Продолжаем, если ABT уменьшает гиперактивность, относительно сохраняет обычные ответы, а эффект согласуется с A1-зависимостью и подтверждённым действием на ADK/аденозин. Какой результат отвергает гипотезу Отвергаем идею избирательного торможения, если обычная сеть подавляется не меньше патологической. Отсутствие A1-зависимости заставляет пересмотреть предложенный механизм. Главная методическая ловушка DPCPX сам может усиливать активность. Сравнение только ABT против ABT + DPCPX без группы DPCPX даёт неоднозначный результат. Внеклеточный аденозин нельзя надёжно оценить по общей экспрессии ADK. Научная опора Фармакология ABT-702 и связь ADK с эпилептогенезом описаны в разных работах [4, 5]. Они не устанавливают оптимальную концентрацию или избирательность в вашей культуре. ПЕРВОИСТОЧНИКИ [4] Jarvis et al. Фармакологическая характеристика ингибитора аденозинкиназы ABT-702. JPET, 2000. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/11082453/ [5] Li et al. Аденозинкиназа как мишень при эпилептогенезе. JCI, 2008. https://doi.org/10.1172/JCI33737 [16] Первичное исследование пространственно-временных свойств кальциевых транзиентов в гиппокампальных нейронах; методы загрузки Fura-2. Frontiers in Cellular Neuroscience, 2022. https://doi.org/10.3389/fncel.2022.1054950

Mechanism

ADK inhibition may increase adenosine availability. Subsequent activation of A₁ receptors limits excitatory transmission. Selectivity according to network state is an assumption to be tested.

Prediction

ABT reduces hyperactivity while relatively preserving ordinary responses, and the effect is consistent with A1 dependence and confirmed action on ADK/adenosine. Loss of the effect under A1 blockade supports the pathway but does not directly measure ADK inhibition. Selective inhibition is rejected if the ordinary network is suppressed at least as much as the pathological network; absence of A1 dependence requires reconsidering the proposed mechanism.

Forecasts

GPT-6 Astra: yesClaude Opus 5.5: yesGemini 4 Argon: yesGrok 4.7: yes

Literature

Literature check in progress
H10Proposed by: Исследования эпилепсии

Research question

Сохраняет ли селективное ограничение NaV1.6 работу тормозных интернейронов лучше карбамазепина при одинаковом снижении патологической активности?

In a neuron–glia culture with preserved GABA transmission, at an equal reduction in pathological discharges, NBI-921352 preserves firing in identified inhibitory neurons and evoked responses better than carbamazepine.

В нейрон-глиальной культуре с сохранённой ГАМК-передачей при равном уменьшении патологических разрядов NBI-921352 лучше сохраняет разряды идентифицированных тормозных нейронов и вызванные ответы, чем карбамазепин. Mechanism: NBI-921352 преимущественно блокирует инактивированные Naᵥ1.6. Относительное сохранение Naᵥ1.1 может уменьшать подавление некоторых классов интернейронов. Prediction: КРИТЕРИЙ ПОДДЕРЖКИ ГИПОТЕЗЫ Продолжаем, если при равном сетевом эффекте NBI лучше сохраняет разрядную способность идентифицированных тормозных клеток и функциональное торможение. РЕЗУЛЬТАТ, ПРОТИВОРЕЧАЩИЙ ГИПОТЕЗЕ Отвергаем преимущество, если оба препарата одинаково угнетают тормозные клетки либо выигрыш исчезает при сопоставимом подавлении сети. ОБЩИЕ УСЛОВИЯ ПЛАНА. Это непроверенная гипотеза и проект эксперимента, а не полученный результат. Рабочая модель — первичная нейрон-глиальная культура; гиппокампальная культура грызуна является допущением плана. Вид, возраст доноров и состав глии уточняют перед запуском. Пилот длится ориентировочно 2–4 недели при освоенной системе, для новой модели или метода 4–8 недель и более. Концентрации и условия растворов выбирают по первичной статье и проверяют пилотом; они не считаются уже установленными. Основная поисковая серия предусматривает минимум 5 независимых приготовлений на условие; это расчёт ресурсов, а не расчёт статистической мощности. Клетки и чашки внутри приготовления не являются независимыми биологическими повторами. Рандомизация, слепой анализ, балансировка условий по возрасту культуры и дню записи обязательны для предложенного дизайна. Технические исключения определяют заранее; исчезновение спайков после препарата не исключают из анализа. Гипотезу оценивают по электрическим разрядам и сохранению вызванных ответов; Fura-2 — вспомогательный показатель. Загрузка Fura-2 занимает ориентировочно 45–75 минут вне установки; подготовка культуры с посевом 6–8 часов. При одном приборе обычно планируются 3–4 чашки в день, для длинных протоколов 2–3; время загрузки можно частично перекрывать со съёмкой. Анализ при готовом алгоритме — ориентировочно 30–60 минут на чашку. Календарные сроки основной серии считаются от первого посева после завершённого пилота; закупки, разработка новых генетических подходов и окончательная подтверждающая серия не включены. Дополнительные разрушительные анализы, patch-clamp, пилоты концентраций и запас на технические потери не включены в указанное число основных оптических чашек. Все сроки являются плановыми оценками, за исключением отдельно обозначенных опубликованных интервалов. Результаты в клеточной культуре не доказывают клиническую эффективность у человека. ПОДРОБНЫЙ ПЛАН ЭКСПЕРИМЕНТА ИЗ ПОДГОТОВЛЕННОГО ДОКУМЕНТА 4. NBI-921352 и сохранение тормозных нейронов Исходная карточка H04 • Мишень: NaV1.6 Проверяем: Сохраняет ли селективное ограничение NaV1.6 работу тормозных интернейронов лучше карбамазепина при одинаковом снижении патологической активности? Модель и подготовка Культура с функциональными возбуждающими и тормозными нейронами. Основной сетевой тест — валидированная модель с пониженным Mg²⁺ и сохранённой ГАМК-передачей. Бикукуллин не подходит для главного вывода о сохранении торможения. Что потребуется NBI-921352, карбамазепин, растворы для low-Mg²⁺ модели; Fura-2, MEA/электростимуляция; patch-clamp; репортёр тормозных клеток или последующая идентификация зарегистрированных клеток по GAD65/67. Для оценки синаптического торможения — отдельные записи IPSC. Группы сравнения 6 условий: исходная и гиперактивная сеть × растворитель, NBI-921352, карбамазепин. На пилоте подбираем сопоставимое сетевое действие веществ. Идентификацию типа клетки выполняем независимо от полученного эффекта. Что делаем по шагам Этап Действие Время DIV0–14 Выращиваем культуру; подтверждаем наличие работающего тормозного компонента. 14 суток; при необходимости дольше до зрелого фенотипа Подготовка чашки Fura-2 и контроль состава внешнего раствора. 45–75 мин вне установки Фон и индукция Пишем исходную активность, затем стабильный low-Mg²⁺ режим. 20–30 мин Воздействие Вносим NBI, карбамазепин или растворитель; измеряем сетевое действие. 25–35 мин Вызванные ответы Повторяем стандартную стимуляцию и заканчиваем оптический сеанс. 15–25 мин На сестринских культурах Регистрируем серии потенциалов действия идентифицированных клеток и синаптические тормозные токи. Обычно 90–150 мин на принятую клетку Один сеанс: 60–90 мин на чашку после загрузки; 3–4 чашки в день. Клеточный patch-clamp считают отдельно. 4. Измерения и сроки Что считаем результатом Сетевой показатель — электрическая нагрузка. Ключевой клеточный показатель — сохранение способности тормозной клетки отвечать серией потенциалов действия при стандартном токовом стимуле; дополнительно оцениваем тормозные синаптические ответы. Дополнительные методы Метод / проверка Действие Время Идентификация клеток Репортёр до записи или фиксация и сопоставление зарегистрированных клеток с GAD-маркерами после записи. Иммуноцитохимия 2 дня; 3–5 ч работы на партию плюс съёмка Patch-clamp по типам клеток Нужны возбуждающие и тормозные клетки, каждый тип распределён по препаратам и независимым культурам. Число клеток не заменяет число культур. 90–150 мин на клетку; ориентир 2–4 успешные клетки за день Планировочный пример 3 режима × 2 типа клеток × 5 приготовлений × 2 клетки = 60 принятых записей. Это оценка нагрузки, не расчёт статистической мощности. 15–30 дней patch-установки; частично параллельно оптике Объём и календарь Основная оптика: 30 чашек, 8–10 рабочих дней установки. Календарь от первого основного посева после пилота: 4–6 недель. Расширенная функциональная проверка при готовых методах: ориентир 7–10 недель; разработка новых генетических подходов и закупки отдельно. Каждая группа должна включать минимум пять независимых приготовлений. Дополнительные разрушающие анализы и клеточные регистрации не включены в число оптических чашек. Когда продолжаем Продолжаем, если при равном сетевом эффекте NBI лучше сохраняет разрядную способность идентифицированных тормозных клеток и функциональное торможение. Какой результат отвергает гипотезу Отвергаем преимущество, если оба препарата одинаково угнетают тормозные клетки либо выигрыш исчезает при сопоставимом подавлении сети. Главная методическая ловушка Средняя Fura-2-кривая и внеклеточная MEA-запись не показывают, какой тип нейрона сохранён. Без типирования клеток главная гипотеза остаётся непроверенной. Научная опора Селективность NBI-921352 и различия действия на возбуждающие и быстроразряжающиеся клетки исследованы экспериментально [6]. Перенос результата в вашу смешанную культуру требует клеточной проверки. ПЕРВОИСТОЧНИКИ [6] Johnson et al. Селективный ингибитор NaV1.6 NBI-921352: клеточная фармакология и доклинические модели. eLife, 2022. https://doi.org/10.7554/eLife.72468 [16] Первичное исследование пространственно-временных свойств кальциевых транзиентов в гиппокампальных нейронах; методы загрузки Fura-2. Frontiers in Cellular Neuroscience, 2022. https://doi.org/10.3389/fncel.2022.1054950

Mechanism

NBI-921352 preferentially blocks inactivated Naᵥ1.6. Relative sparing of Naᵥ1.1 may reduce suppression of some classes of interneurons.

Prediction

At an equal network effect, NBI better preserves the firing capacity of identified inhibitory cells and functional inhibition. The advantage is rejected if both drugs suppress inhibitory cells equally or if the advantage disappears at comparable network suppression.

Forecasts

GPT-6 Astra: yesClaude Opus 5.5: yesGemini 4 Argon: yesGrok 4.7: yes

Literature

Literature check in progress

All hypotheses

Every hypothesis of the set with the forecast of each model. Click a column header to sort.

No.▲Hypothesis▲Author▲GPT‑6 Astra▲Claude Opus 5.5▲Gemini 4 Argon▲Grok 4.7▲Result▲Literature▲
H5In a neuron–astrocyte network with albumin-induced astrocyte changes, temporary inhibition of the TGF-β signaling pathway by SB-431542 will prevent subsequent hyperexcitability after compound removal; the effect will be associated with preservation of functional extracellular K⁺ clearance.
Mechanism and prediction

Mechanism. The proposed chain is albumin exposure → astrocytic TGF-β signaling → impaired potassium buffering → persistent hyperexcitability. SB-431542 is used as a tool, but blocks ALK4/5/7 rather than only ALK5.

Prediction. Support requires early intervention to prevent persistent hyperexcitability after compound removal and preserve functional K⁺ clearance; late intervention separately assesses the reversibility of the changes. If the effect disappears after complete washout, it does not represent prevention of persistent remodeling. If hyperexcitability decreases without restoration of K⁺ control, the potassium explanation specifically is rejected.

Исследования эпилепсииyesyesyesyesSelectedLiterature check in progress
H6In neuron–astrocyte networks with a measured deficit in glutamate clearance, increasing EAAT2 function through treatment with LDN/OSU-0212320 will shorten pathological discharges while relatively preserving brief evoked responses.
Mechanism and prediction

Mechanism. LDN/OSU-0212320 has been reported to increase EAAT2 translation with involvement of PKC–YB-1. The functional target is glutamate transport; this does not imply direct binding of the compound to EAAT2.

Prediction. Glutamate transport and network function improve together; whether the effect is stronger in cultures with a baseline transport deficit is assessed. If uptake increases but discharges remain unchanged, the explanation based on insufficient glutamate clearance in this model is rejected. If discharges decrease without increased uptake, the EAAT2 mechanism is not established.

Исследования эпилепсииyesyesyesyesSelectedLiterature check in progress
H8In a hippocampal neuron–glia culture, inhibition of adenosine kinase by ABT-702 reduces pathological activity more strongly than evoked responses in the baseline network; this advantage depends on A₁ receptors.
Mechanism and prediction

Mechanism. ADK inhibition may increase adenosine availability. Subsequent activation of A₁ receptors limits excitatory transmission. Selectivity according to network state is an assumption to be tested.

Prediction. ABT reduces hyperactivity while relatively preserving ordinary responses, and the effect is consistent with A1 dependence and confirmed action on ADK/adenosine. Loss of the effect under A1 blockade supports the pathway but does not directly measure ADK inhibition. Selective inhibition is rejected if the ordinary network is suppressed at least as much as the pathological network; absence of A1 dependence requires reconsidering the proposed mechanism.

Исследования эпилепсииyesyesyesyesSelectedLiterature check in progress
H10In a neuron–glia culture with preserved GABA transmission, at an equal reduction in pathological discharges, NBI-921352 preserves firing in identified inhibitory neurons and evoked responses better than carbamazepine.
Mechanism and prediction

Mechanism. NBI-921352 preferentially blocks inactivated Naᵥ1.6. Relative sparing of Naᵥ1.1 may reduce suppression of some classes of interneurons.

Prediction. At an equal network effect, NBI better preserves the firing capacity of identified inhibitory cells and functional inhibition. The advantage is rejected if both drugs suppress inhibitory cells equally or if the advantage disappears at comparable network suppression.

Исследования эпилепсииyesyesyesyesSelectedLiterature check in progress
H1At comparable baseline electrical burden, AFC-5128 will suppress pathological discharges more strongly in inflammatory neuron–glia networks with an increased functional P2X7 response than in networks without this state, while preserving evoked responses.
Mechanism and prediction

Mechanism. ATP-dependent P2X7 may link damage and inflammatory signaling to hyperexcitability. The effect is proposed to depend on network state; the contributions of neurons and glia are not considered established in advance.

Prediction. Support requires the inflammatory phenotype to be associated with a greater response to AFC after accounting for baseline severity, with an action consistent with P2X7 blockade. If the advantage disappears at comparable baseline activity, inflammation is not confirmed as an independent predictor. If AFC does not block P2X7 in the selected species, the network test is uninformative.

Исследования эпилепсииnonononoRejectedNot checked after rejection
H2If NOX2-dependent oxidation sustains established hyperactivity in a neuron–glia culture, GSK2795039 added after hyperactivity has stabilized will reduce the pathological electrical burden while preserving evoked responses; its effect will not be limited to reducing ROS and cell death.
Mechanism and prediction

Mechanism. GSK2795039 inhibits NOX2, one source of reactive oxygen species. Feedback between oxidative changes and excitability is proposed. Stopping discharges and protecting against their consequences are treated as distinct possible effects.

Prediction. Support requires reduced electrical burden following late intervention with confirmed action on NOX2. Replication using an independent tool distinguishes the mechanism from an off-target effect of the compound. If ROS and damage decrease but discharges persist, the role of NOX2 in sustaining activity in this model is rejected, while neuroprotection may remain a separate result.

Исследования эпилепсииnonononoRejectedNot checked after rejection
H3In a neuron–glia network with functional mGlu2-dependent feedback, LY487379 will preferentially limit prolonged pathological bursts while preserving single evoked responses better than direct suppression of excitatory transmission at comparable efficacy.
Mechanism and prediction

Mechanism. LY487379 is a positive allosteric modulator of mGlu2. In characterized systems, it enhanced the action of glutamate without an independent agonist effect. Dependence on the endogenous signal may provide selectivity for the activity pattern, but does not guarantee it.

Prediction. Support requires confirmed functional mGlu2, better preservation of normal responses than with the comparator at an equal network effect, and dependence on GRM2 without impairment of inhibitory transmission. The proposed advantage is rejected if disinhibition appears, there is no benefit at an equal network effect, or the action does not depend on GRM2.

Исследования эпилепсииnonoyesnoRejectedNot checked after rejection
H4In a neuron–glia culture, if the reduced response to diazepam is caused by chloride accumulation in neurons, activation of KCC2 by compound “350” will restore the chloride gradient and network sensitivity to diazepam.
Mechanism and prediction

Mechanism. KCC2 promotes chloride extrusion from neurons. Restoration of the GABA response reversal potential may restore the effectiveness of GABAergic inhibition.

Prediction. 350 corrects the functional Cl⁻ defect, followed by restoration of diazepam action and reduction of pathological electrical discharges. An independent intervention in KCC2 with its own control is added for a causal conclusion. If the gradient is corrected but diazepam remains ineffective, the specific hypothesis is not supported. If the defect is not reproduced, a negative network result does not yet test the hypothesis.

Исследования эпилепсииyesnoyesyesRejectedNot checked after rejection
H7In a neuron–glia culture, moderate or time-limited modulation of SK2/3 by CyPPA reduces the electrical burden of pathological discharges before a sustained increase in basal Ca²⁺ appears; within this window, evoked responses are preserved better than during longer exposure to CyPPA.
Mechanism and prediction

Mechanism. SK channels couple increased intracellular calcium to a potassium current and subsequent hyperpolarization. CyPPA increases their sensitivity to calcium. Discharge suppression and disruption of calcium homeostasis may be separable in time.

Prediction. Support requires reproducibly identifying an interval in which electrical discharges decrease, normal responses are preserved, and basal Ca²⁺ and delayed damage do not worsen. The useful-window hypothesis is rejected if every effective regimen simultaneously increases basal Ca²⁺, damages cells, or suppresses normal responses equally.

Исследования эпилепсииyesyesyesnoRejectedNot checked after rejection
H9In a primary hippocampal neuron–glia culture, at an equal reduction in the total duration of epileptiform discharges, the combination of retigabine and perampanel preserves evoked responses better than either component alone.
Mechanism and prediction

Mechanism. Activation of Kv7 potassium channels limits excitability, while blockade of AMPA receptors reduces the spread of excitation. The possibility of reducing the burden on each mechanism is being tested.

Prediction. The combination preserves evoked responses better at a comparable reduction in discharges and without loss of viability, with the advantage confirmed in a new independent series. The claimed advantage is rejected if the effect is explained by deeper network suppression or if the difference disappears after matching the antiepileptiform effect.

Исследования эпилепсииnonononoRejectedNot checked after rejection